Afin d'assurer une recherche scientifique rigoureuse, le LSE est engagé auprès de l'INRAE dans une démarche qualité reposant sur les objectifs suivants :

• Assurer la traçabilité des travaux de recherche
• Améliorer la fiabilité des résultats mesurables et pouvoir la prouver
• Donner des garanties quant à :

1. la qualité des équipements, données, méthodes et matériels fournis aux partenaires et bénéficiaires de la recherche
2. la pérennité des données et de leurs traitements

• Améliorer le fonctionnement
• Contribuer à la maîtrise des risques sur le domaine des activités de recherche
• Ce système s'inscrit ainsi dans une volonté d'amélioration continue de l'ensemble des pratiques et activités du LSE.

Afin de déployer la démarche qualité, le laboratoire dispose d’une cellule qualité, d’un animateur qualité et d’un responsable métrologie.

L’ensemble de la démarche qualité s’appuie sur une approche processus afin de faciliter l’organisation de l’ensemble des activités.