Titre de la thèse : Analyse de la diversité des bactéries endophytes et rhizosphériques en vue d’isoler des bactéries pouvant stimuler la croissance de Synsepalum dulcificum (Schumach & Thonn.) Daniell.

Synsepalum dulcificum (Schumach & Thonn.) Daniell est un arbuste originaire de l’Afrique de l’Ouest qui est célèbre pour ses baies rouges connues pour être, à ce jour, la seule source naturelle de « miraculine », une glycoprotéine à propriété édulcorante contenue dans la pulpe du fruit. En Afrique de l’Ouest, cette espèce végétale a plus de 70 applications locales documentées sur le plan alimentaire, médicinal, pharmaceutique et économique qui font d’elle, une ressource bioéconomique stratégique dont la production importante permettrait d’accélérer le développement socio-économique des pays producteurs et exportateurs. Cependant, sa culture est encore très peu développée et est soumise à plusieurs contraintes de production incluant : la croissance lente, la période juvénile prolongée et les attaques des bioagresseurs. Ainsi, dans un contexte de protection agro-écologique des productions végétales, l’utilisation de bactéries d’intérêt dites PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) et PGPE (Plant Growth Promoting Endophyte), favorisant d’une part, l'absorption des éléments nutritifs par les plantes et d’autre part, la croissance des plantes inoculées, apparaît comme un levier novateur et durable. C’est dans ce cadre que s’inscrit cette étude qui vise à i) étudier la diversité des communautés rhizosphériques et endophytes bactériennes d’un panel d’accessions de S. dulcificum, ii) isoler des bactéries d’intérêts en vue de créer un consortium pouvant stimuler la croissance de S. dulcificum, iii) évaluer l’effet de l’inoculum bactérien mixte créé sur la croissance juvénile de S. dulcificum et iv) cerner les gènes exprimés par les plantes après inoculation par des approches de RNAseq.

Cette étude fournira aux agriculteurs des stratégies durables pour une intensification de la production de cette culture et une amélioration de sa qualité nutritionnelle afin de satisfaire aux besoins des marchés nationaux et internationaux.